细胞基本属性 | |||||
产品名称 | ATG16 knockout HeLa cell line | ||||
产品货号 | IMKO-H015 | ||||
产品规格 | 1×106cells/T25或1mL冻存管 | ||||
储存及运输 | 干冰运输;储存在液氮中 | ||||
产品分类 | Hela细胞 | ||||
物种 | 人 | ||||
修饰基因 | ATG16 | ||||
修饰类型 | 基因敲除 | ||||
转导方法 | CRISPR/Cas9 | ||||
克隆类型 | 纯化克隆 | ||||
细胞鉴定 | 通过遗传学方法确认ATG16基因敲除 | ||||
细胞形态 | 上皮细胞样 | ||||
生长特性 | 贴壁生长 | ||||
培养体系 | 90%MEM+10% FBS+1%PS | ||||
传代比例 | 1:2至1:3 | ||||
传代周期 | 每周3次 | ||||
培养条件 | 气相:95%空气+5%二氧化碳;温度:37℃ | ||||
冻存条件 | 无血清冻存液,液氮储存 | ||||
补充内容 | ATG16L1是一个编码蛋白质的基因,与ATG16L1相关的疾病包括炎症性肠病10和炎症性肠病。该基因与自噬和选择性自噬等相关通路有关,是维持细胞稳态关键的基因之一。ATG16在自噬中发挥着重要作用,似乎将自噬与泛素蛋白酶体系统(UPS)联系在一起。该基因在自噬体的形成过程中起着调控作用,通过与ATG5和LC3-II等复合体相互作用,参与自噬体的组装和分解过程。 ATG16基因在很多物种中高度保守,包含ATG5相互作用结构域、螺旋卷曲区域和七片叶片状β-螺旋蛋白WD40结构域,这些结构域在蛋白质相互作用中起着重要作用。通过ATG12-ATG5复合体、ATG16等复合体的非共价相互作用,调控和介导自噬体的形成和降解过程,维持细胞内部环境的稳定。 总的来说,ATG16L1基因在细胞自噬过程中具有重要作用,与疾病的发生和细胞内稳态的保持密切相关。进一步的研究和探索ATG16L1基因的功能和调控机制,有助于深入了解自噬通路和细胞代谢的调控机制,为相关疾病的治疗和预防提供重要参考。 | ||||
构建方法 | ![]() | ||||
ATG16L1基因敲除细胞系的构建通常涉及的步骤 | 1. 使用合成生物学工具设计特异性sgRNA序列,可以靶向ATG16L1基因的编码区域,以实现基因敲除。 2.将设计好的sgRNA序列克隆进CRISPR/Cas9基因组编辑系统的载体中,用于在细胞内靶向ATG16L1基因。 3.将构建好的CRISPR/Cas9载体转染进目标细胞系,让其表达Cas9蛋白和sgRNA,从而引导Cas9蛋白靶向切割ATG16L1基因。 4.使用特定筛选方法,如PCR、Western blot等技术,确认哪些细胞成功进行了ATG16L1基因的敲除。 5. 对已经确认成功敲除ATG16L1基因的细胞进行克隆,获得单克隆细胞系,以确保后续实验的一致性和可重复性。 | ||||
ATG16L1基因的基本信息 | Species | Gene Symbol | Gene ID | GenBank Accession | Transcript |
Human (Homo sapiens) | ATG16L1 | 55054 | NP_001177195.1 | NP_001177195.1 | |
关于基因 | Official Symbol | ATG16L1 | |||
Previous Symbol | ATG16 | ||||
Official Full Name | autophagy related 16-like 1 | ||||
Synonyms | APG16L, ATG16A, ATG16L, FLJ10035, WDR30 | ||||
Location | 2q37.1 | ||||
Gene Type | Autophagy-related gene | ||||
Uniprot ID | Q17RG0, Q53SV2 | ||||
Pathway/Library | Autophagy Pathway;Inflammatory Bowel Disease Pathway;Cell Homeostasis Pathway; | ||||
Gene Summary | The ATG16L1 gene encodes a protein that plays a crucial role in the autophagy process, specifically in the formation and regulation of autophagosomes. Autophagy is a cellular process in which cells degrade and recycle components to maintain cellular homeostasis. ATG16L1 is essential for the proper functioning of the autophagy-related ATG12-ATG5/ATG16 complex and the lipidation of LC3, a key step in autophagosome formation. ATG16L1 has been associated with inflammatory bowel diseases, particularly Crohn's disease, highlighting its importance in immune responses and disease susceptibility. The protein encoded by ATG16L1 is involved in maintaining cellular homeostasis, regulating cell survival, and contributing to controlled cell death processes. Understanding the role of ATG16L1 in autophagy and disease pathogenesis can provide valuable insights into potential therapeutic strategies for related conditions. |
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