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ATG16 knockout HeLa cell line

ATG16 knockout HeLa cell line

产品货号:IMKO-H015

产品规格:1×106cells/T25或1mL冻存管

生长特性:贴壁生长

细胞形态:上皮细胞样

培养体系:90%MEM+10% FBS+1%PS


价格:9000元

搭配培养体系
 细胞基本属性
产品名称ATG16 knockout HeLa cell line
产品货号IMKO-H015
产品规格1×106cells/T25或1mL冻存管
储存及运输干冰运输;储存在液氮中
产品分类Hela细胞
物种
修饰基因ATG16
修饰类型基因敲除
转导方法CRISPR/Cas9
克隆类型纯化克隆
细胞鉴定通过遗传学方法确认ATG16基因敲除
细胞形态上皮细胞样
生长特性贴壁生长
培养体系90%MEM+10% FBS+1%PS
传代比例1:2至1:3
传代周期每周3次
培养条件气相:95%空气+5%二氧化碳;温度:37℃
冻存条件无血清冻存液,液氮储存

补充内容

ATG16L1是一个编码蛋白质的基因,与ATG16L1相关的疾病包括炎症性肠病10和炎症性肠病。该基因与自噬和选择性自噬等相关通路有关,是维持细胞稳态关键的基因之一。ATG16在自噬中发挥着重要作用,似乎将自噬与泛素蛋白酶体系统(UPS)联系在一起。该基因在自噬体的形成过程中起着调控作用,通过与ATG5和LC3-II等复合体相互作用,参与自噬体的组装和分解过程。 ATG16基因在很多物种中高度保守,包含ATG5相互作用结构域、螺旋卷曲区域和七片叶片状β-螺旋蛋白WD40结构域,这些结构域在蛋白质相互作用中起着重要作用。通过ATG12-ATG5复合体、ATG16等复合体的非共价相互作用,调控和介导自噬体的形成和降解过程,维持细胞内部环境的稳定。 总的来说,ATG16L1基因在细胞自噬过程中具有重要作用,与疾病的发生和细胞内稳态的保持密切相关。进一步的研究和探索ATG16L1基因的功能和调控机制,有助于深入了解自噬通路和细胞代谢的调控机制,为相关疾病的治疗和预防提供重要参考。

构建方法图片2.jpg
ATG16L1基因敲除细胞系的构建通常涉及的步骤

1. 使用合成生物学工具设计特异性sgRNA序列,可以靶向ATG16L1基因的编码区域,以实现基因敲除。 

2.将设计好的sgRNA序列克隆进CRISPR/Cas9基因组编辑系统的载体中,用于在细胞内靶向ATG16L1基因。 

3.将构建好的CRISPR/Cas9载体转染进目标细胞系,让其表达Cas9蛋白和sgRNA,从而引导Cas9蛋白靶向切割ATG16L1基因。 

4.使用特定筛选方法,如PCR、Western blot等技术,确认哪些细胞成功进行了ATG16L1基因的敲除。 

5. 对已经确认成功敲除ATG16L1基因的细胞进行克隆,获得单克隆细胞系,以确保后续实验的一致性和可重复性。 

ATG16L1基因的基本信息

Species

Gene Symbol

Gene ID

GenBank Accession

Transcript

Human (Homo sapiens)

ATG16L1

55054

NP_001177195.1

NP_001177195.1

关于基因Official SymbolATG16L1
Previous SymbolATG16
Official Full Nameautophagy related 16-like 1
SynonymsAPG16L, ATG16A, ATG16L, FLJ10035, WDR30
Location2q37.1
Gene TypeAutophagy-related gene
Uniprot IDQ17RG0, Q53SV2
Pathway/LibraryAutophagy Pathway;Inflammatory Bowel Disease Pathway;Cell Homeostasis Pathway;
Gene SummaryThe ATG16L1 gene encodes a protein that plays a crucial role in the autophagy process, specifically in the formation and regulation of autophagosomes. Autophagy is a cellular process in which cells degrade and recycle components to maintain cellular homeostasis. ATG16L1 is essential for the proper functioning of the autophagy-related ATG12-ATG5/ATG16 complex and the lipidation of LC3, a key step in autophagosome formation. ATG16L1 has been associated with inflammatory bowel diseases, particularly Crohn's disease, highlighting its importance in immune responses and disease susceptibility. The protein encoded by ATG16L1 is involved in maintaining cellular homeostasis, regulating cell survival, and contributing to controlled cell death processes. Understanding the role of ATG16L1 in autophagy and disease pathogenesis can provide valuable insights into potential therapeutic strategies for related conditions.

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